Secuencia de aminoácidos: cómo se lee la de un péptido
La secuencia de aminoácidos es el orden de los residuos de un péptido, escrito desde el extremo amino (N-terminal) hasta el extremo carboxilo (C-terminal). Es su estructura primaria y la que determina su fórmula, su masa y buena parte de su comportamiento.
Se escribe con códigos de tres letras separados por guiones o con una letra por residuo. BPC-157 es Gly-Glu-Pro-Pro-Pro-Gly-Lys-Pro-Ala-Asp-Asp-Ala-Gly-Leu-Val, o GEPPPGKPADDAGLV; KPV es Lys-Pro-Val. Una «D» delante de un residuo indica la forma D, y los residuos no naturales llevan abreviaturas propias, como Nle para la norleucina.
Las modificaciones de los extremos se anotan fuera de la secuencia: «Ac-» delante indica un extremo amino acetilado y «-NH2» al final, un extremo carboxilo amidado. Así se lee el fragmento de TB-500, Ac-LKKTETQ.
Dos péptidos con los mismos aminoácidos en otro orden tienen la misma fórmula y la misma masa, pero son moléculas distintas. Por eso la masa confirma la composición y la fragmentación en espectrometría de masas, el orden.
Comparar la secuencia de aminoácidos con la literatura
La secuencia es lo que distingue moléculas con nombres parecidos, como HGH y HGH Fragment 176-191 o PT-141 y Melanotan 2, y lo que hay que comparar con la literatura antes de trasladar un resultado de un compuesto a otro.
Términos relacionados
Volver al glosario técnico o ver el catálogo de péptidos.